Ты не совсем правильно понимаешь проблему, с наружи идет на преобразователь чистое питание без пилы. Стабиллизатор преобразует +12 вольт в другие напряжения +12 -12 +5 +3.3 , сами преобразователи используют ШИМ и в итоге после преобразования они ставят просто пару емкостей на выходе и мы имеем не сглаженую пилу в большой амплитуды
Нужно бы дросель массовой стабиллизации воткнуть или раздельные доросели на каждый канал питания.