Вообщем тема больная и нужно ее лечить.
Пользуюсь вот этим сканером. Приложеный сканер уже настроен как нужно. Выберите закладку "Tag Editor", укажите путь к вашим МР3, потом выделить все файлы и сохранить. Пока лучше способа я не нашел.
Если у кого есть другие решения пишите , делитесь.